1. 粪便常规 （RT）及隐血（或称潜血，OB）试验
用竹签挑取少许新鲜粪便（约蚕豆大小），应选择其中有脓血、粘液的部分或颜色异常部分，如无异常，则可自粪便表面不同部位及粪便深处多部位取材，放入干燥清洁的采便管立即送检，一定不要超过2小时。
样本中不可混有尿液，也尽量不要混有便盆或便池中的其它液体，避免混入植物、泥土、花粉等异物。粪便样本不得用纸类包裹或放入吸水纸盒中，以防水分丢失、细胞被破坏；容器中不得含有任何药物成分。隐血试验时应避免在检查前3日服用大量维生素C。
2. 粪便寄生虫检查样本
2.1 检查寄生虫卵样本留取方法及注意事项同便常规检查。
2.2 检查阿米巴滋养体应于排便后立即从脓血性或稀软部分取材，迅速（2小时内）送检，患者在家中留取样本时，送检过程中应采取保温措施。
2.3 检查蛲虫卵时，在清晨排便前自肛门四周皱襞处拭取样本，立即（2小时内）送检。
3. 粪便培养样本
准备无菌便盒。采集新鲜粪便，采集样本过程应尽量无菌操作。① 直肠拭子法（由护士完成）②自然排便法：病人在清洁便盆内排便，用竹签挑取大便中脓血或粘液部分（约栗子大小，2~3g；液体粪便取絮状物2~3ml），放入无菌便盒中送检，注意所挑取的大便不应接触其它部位，如便盆。注意尽可能在使用抗生素使用之前收集粪便。